墨西哥物种资源丰富，是全球5个拥有最多物种的国家之一。遍布墨西哥的高山松林、炙热沙漠和潮湿的热带雨林构成了一个庞大的生态系统网络：墨西哥有526种哺乳动物，居世界第2位。爬行动物种类位居世界首位，墨西哥国家统计局提供的资料显示，全世界700多种爬行动物中有570多种栖息在墨西哥。有1150种鸟类，居世界第10位。鹿和丛林狼广泛分布于马德雷山系。西马德雷山脉北部边远地区仍可见到灰狼。灰熊在1960年以后，可能已在野外灭绝，但黑熊的数量相当稳定。大型猫科动物（美洲豹和美洲狮）已相当稀少，但棉尾兔很多，环颈西猯还相当多，野火鸡和较小的猎鸟亦为数不少。海牛、雪貂、海龟、白尾鹿、鳄鱼、红足塔兰图拉毒蜘蛛等动物因人为滥捕已濒临灭绝。估计900多种受到墨西哥法律保护的动物中，部分稀有物种在今后10年内有可能从墨西哥国土上消失。