巴布亚新几内亚卫生状况不是很好，民众的健康也受到影响。巴布亚新几内亚全国有19所医院，240多家诊所。公立医院看病基本免费，但服务质量一般。全国医疗卫生基础设施落后，普遍缺乏医生、药品，难以保障病人就医需求。私人医院看病收费较高。偏远地区医疗条件更差，有些地区甚至无医院、医生。巴布亚新几内亚的婴儿死亡率较高，2009年5岁以下儿童死亡率在6.8%，这一水平在世界上排名靠前。巴布亚新几内亚主要传染疾病有疟疾、登革热等，肺结核、肝炎、伤寒等疾病也较为普遍。近年来，艾滋病在巴布亚新几内亚的形势较为严峻。国际诸多援助项目与此有关。巴布亚新几内亚的艾滋病形势在南太平洋地区最为严重。巴布亚新几内亚是1987年开始进行有关艾滋病的血液检查的，之前艾滋病有可能已经在巴布亚新几内亚存在了。虽然现在还不能准确统计出全国有多少受感染的艾滋病病人，很多感染者并不知道已经受到感染，只有很少的病人进行化验，但是超过万人感染艾滋病是可信的。根据2009年9月的数据，有2.83万个艾滋病例得到确诊。很多因艾滋病而去世的患者都可能被当作因结核、疟疾或者是肺炎等病致死的。目前艾滋病在巴布亚新几内亚还有恶化趋势。根据巴布亚