历史上，巴拿马工人运动在组织上比较分散，在国家政治生活中的影响有限。在运河区主权移交之前，运河区内做工的巴拿马人属于美国工会，而不属于巴拿马工会。这种状况在巴拿马完全控制运河以后才有所改观。在托里霍斯将军执政期间，各大工会组织曾经合而为一，工会组织的规模和影响力有所增加。但不同的成分和诉求妨碍了工会组织以统一的立场和声音来维护工人阶层的基本利益。20世纪80年代，工会组织虽组织罢工运动进行抗议，但未能阻止政府对劳工法的修改。目前，巴拿马参加工会的工人比重仍较低，仅为12%。巴拿马的主要工会组织有“巴拿马共和国工人联合会”（Confederacion de Trabajadores de la Republica de Panama），成立于1956年，为国际自由工会联合会和美洲地区工人组织成员；“巴拿马全国工人中央工会”（Central Nacional de Trabajadores de Panama），成立于1970年，为世界工会联合会和拉美工人团结常设代表大会成员；“巴拿马工人中央总工会”（Central General de Trabajadores de Panama），成