13世纪初，崛起的蒙古鞑靼人经过几十年的征战，建立了一个庞大的帝国。处在分裂和内讧状态的罗斯没有经过多少抵抗，就落入蒙古鞑靼人的统治之下了。1240年，早期罗斯首都基辅被蒙古鞑靼人占领，整个东北罗斯归入蒙古鞑靼人的势力范围，罗斯从此开始了长达240年的异族统治时代。作为独立的国家，罗斯已经不存在，只有一个个在蒙古鞑靼人统治下苟延残喘的弱小公国。罗斯教会却奇迹般地保存下来，尽管在罗斯被占领初期曾遭到一定的破坏。当时的蒙古鞑靼人是多神教徒，崇拜各种神灵，对各类宗教都表现出多神教徒所特有的宽容，无论是佛教、伊斯兰教还是基督教。这种宽容的宗教政策是由成吉思汗自己制定的，他的继承者都遵循了这个原则。成吉思汗的孙子拔都是占领罗斯的关键人物。拔都自己不属于任何宗教派别，只崇拜统一的上帝，这个上帝没有具体的形象和特征，实际上是多神教的神，因此拔都是个典型的多神教徒。在占领罗斯后，拔都并没有迫害东正教会，相反，他认为必须保卫蒙古帝国里的东正教会，给它以充分的自由。1246年，根据拔都和贵由的命令，在罗斯进行了一次人口普查，但宗教界被排除在外，没有遭到惊扰。即使在个别蒙古汗皈依伊斯兰教之后，东正教会也没有