2000年，奉行“渐进式台独”的陈水扁在李登辉帮助下以微弱多数上台掌权。陈水扁拒不接受一个中国原则，不承认两岸达成的同属一个中国的“九二共识”；而且在2002年8月公然抛出台湾和大陆是“一边一国”的“两国论”，鼓吹只有2300万台湾人民才有权利决定台湾的前途，还说台湾要以公民投票来决定台湾的统独。陈水扁还提出一个“台独时间表”，即在2006年举行公投制宪，在2008年实施“国家新宪法”，实现“台湾法理独立”；并推动所谓“台湾正名”活动，大搞“去中国化”勾当，台湾的单位名称、机构标志、出境护照统统都要将“中国”两字去掉。针对“台独”势力的分裂活动，大陆迅速出台一系列应对措施。2003年3月11日，中国国家主席胡锦涛发表四点意见：第一，坚持一个中国原则决不动摇；第二，争取和平统一的方式决不放弃；第三，贯彻寄希望于台湾人民的方针决不改变；第四，反对“台独”分裂活动决不妥协。这四点意见表达了大陆解决台湾问题的坚定立场和主动性、灵活性与包容性。2004年5月中共中央授权中台办发表“5·17声明”，指出台湾当局必须在“统一”和“台独”两条路上做出选择，并奉劝陈水扁在“台独”的道路上悬崖勒马。200