奥斯曼帝国的入侵给巴尔干半岛的各国带来了深重的灾难，它不仅摧毁了巴尔干中世纪国家及其文化传统，而且引起巴尔干地区的人口结构发生根本的变化。15～18世纪，是奥斯曼帝国向外侵略扩张的极盛时期。它在征服大片欧洲土地的同时，大力推行移民政策和伊斯兰化运动，其中受害最深的是巴尔干西部的阿尔巴尼亚、科索沃、西马其顿和波斯尼亚等地。所以，巴尔干地区穆斯林的起源同奥斯曼帝国的入侵和统治是分不开的。巴尔干学者普遍认为，巴尔干半岛上的穆斯林是奥斯曼帝国向新征服地区移民和同化当地居民的产物，他们主要由三部分人组成：（1）来自土耳其本土的突厥人移民；（2）从欧洲被征服地区迁来的不同民族的战俘和自由奴；（3）当地被伊斯兰化的居民。40231754这样，在长达5个世纪的统治下，在巴尔干地区逐渐形成了两种略有区别的穆斯林：被伊斯兰化了的穆斯林和来自土耳其本土的穆斯林。那些保留了原有的语言和民族意识而皈依伊斯兰教的当地居民，称为被伊斯兰化了的穆斯林，他们是一个特殊的族群，如保加利亚的“波玛齐人”、“马其顿穆斯林”、“波黑穆斯林”等；而那些从土耳其本土迁移来的人及其后裔，他们仍讲土耳其语和信奉伊斯兰教，则被称为土耳其