联邦政府和州政府在监管（regulate）非营利部门方面负有主要责任，同时它们也掌控着对非营利组织进行支持和激励的主要资源和机制。州以下层面的地方政府情况比较复杂。总体而言，虽然许多地方政府也制定了管理非营利组织慈善募捐或使用公共场所的法律法规，但它们同非营利组织关系的更侧重于通过各种形式的合作向本地居民提供公共服务，解决形形色色的经济与社会问题。无论是联邦政府还是州政府，监管的头号重点都围绕一个“钱”字，即非营利组织的财务和税务。因为绝大多数非营利组织都享受联邦或所在州的免税待遇，而免税待遇又与非营利组织的宗旨，尤其是众多符合501（c）（3）条款的公益慈善机构的宗旨以及它们为社会提供的服务密切相关。如果它们在财税方面出现问题，那么非营利部门的公信力就会受到质疑，捐赠者的利益就会受损，公众给予非营利组织的捐赠也会下降，从而导致这些组织无法持续发展，它们所提供的公共服务也会出现短缺。除了财税方面外，各级政府的关注点还包括：提高非营利组织的内部治理水平，用制度规范理事会或监事会成员的行为；防止公益慈善群体组织违规介入政治性竞选活动；警惕和防范各种恐怖分子、极端势力和经济犯罪分子以非营利组