实行全民全国国防与安全整体防卫，建立印尼国民军、中央和地方两级国防力量及安全机构。设立国防部，专司制定国防政策。国民军由海、陆、空三军组成。总统通过三军总司令统领国民军，控制军队各战略部门。政府负责经常、全面、可靠、有序、连续不断的国防准备工作。确立国家主权、领土完整、共和国统一、保卫全体人民安全的国防观。印尼政府认为，印尼未来面临的威胁可能局面是：来自外国的侵略可能性很小，联合国的作用和国际社会的反应能够制止、起码可以限制一个国家使用武力强迫别的国家接受其意志。来自外部的威胁很大的可能性是以非国家形式的有组织的跨国犯罪。估计印尼将面临的威胁是恐怖主义、分离主义运动、跨国刑事犯罪活动，如走私、非法捕鱼、海盗、劫机、武器走私、贩卖妇女、环境污染和破坏、非法移民、劫持和抢劫、极端主义、社会冲突、自然灾害。根据对国内外威胁可能性的基本估计，印尼国防战略政策的主要方向是面对上述所谓“非传统的威胁”，包括对亚齐和巴布亚的分离主义运动采取所谓“非战争军事行动”。政策重点是坚持“努山塔拉”群岛观念，实行以大岛为核心的群岛战略，建立独立防卫与机动作战相结合的防御体系。加强海域（南海、印度洋