运输业产值占国内生产总值的比重不大，2000年为3.82%。“六五”计划（1994～1998）政府将运输业发展的重点放在地方，特别是东部地区，以加强工业、农业、贸易及旅游业发展，通过提高运输质量来提升基础设施、社区服务、人力资源。为达此目的，广泛开展了公路、桥梁建设，改善陆路、水路及航空运输，并进行气象、地理资源，教育培训。陆路运输比较发达地区是爪哇、苏门答腊、苏拉威西、巴厘岛等。这些地区的高速公路和二级公路较其他地区先进，偏远地区和移民地区交通运输相对滞后。全国公路网在1989～1993期间即已形成。在偏远地区、都市发展地区、移民地区、生产开发地区及战略地区均开展了公路和桥梁建设。全国公路总长34万多公里。爪哇、北苏门答腊、南苏门答腊、马都拉、巴厘是国内公路运输最发达的地区。大多数城市都有高速公路和二级公路。2002年客车、公共汽车、卡车、摩托车等各种车辆2298.5万多辆，比10年前增长55.6%。印尼铁路最早建于1864年的中爪哇。后扩大到苏门答腊、亚齐、廖内等地。荷兰殖民主义政府修建铁路的目的旨在加强对印尼农产品、经济种植产品及矿产品的掠夺，加强对印尼上游和下游产品的出口。印尼