1949年12月28日，印尼与美国建交。苏加诺时代奉行反帝、反殖、支持亚非拉民族解放和民主运动的政策，与美官方关系冷淡。1963年，美国停止对印尼援助，双方关系迅速恶化。1966年苏哈托执政后，两国关系全面恢复。双方在政治、经济、军事、文化、科技、教育等各个领域开展了交往与合作。两国领导人互访不断，苏哈托总统于1975年、1982年和1995年3次访问美国，美国总统尼克松（1969年）、福特（1975年）和克林顿（1994年）先后访问了印尼。苏哈托下台后，1999年11月瓦希德总统，在出席联合国千年首脑会议期间访美。梅加瓦蒂接任总统后也于2001年9月出访了美国。访美期间，布什总统明确表示，支持梅加瓦蒂在印尼推行的经济改革计划，承诺向印尼提供6.574亿美元的经济援助，并承诺将要求美国会拨款1.3亿美元，以协助印尼司法制度改革。为支持印尼的民主和经济改革措施，美国将给予印尼木材、铜矿、金枪鱼等11种产品免税进口的优惠待遇。2003年10月，布什总统在参加曼谷APEC会议后赴印尼巴厘岛短暂停留，与梅加瓦蒂总统发表联合声明，一致同意加强反恐合作，美重申支持印尼领土完整和民主改革，并向印尼提