厄立特里亚主要有两大宗教，即基督教和伊斯兰教。信仰基督教与伊斯兰教的居民数量大致相当，另外还有少数人信仰传统宗教。从地理分布上看，高原地区的居民大多信奉基督教，西部低地、北部高原和东部沿海平原一带的居民信奉伊斯兰教。基督教主要是埃塞俄比亚东正教，另有少数人信仰罗马天主教和基督教新教。伊斯兰教从公元7世纪起通过商人传入厄立特里亚。厄立特里亚穆斯林大部分为逊尼派，少数属苏菲派。两大派之下，又可分为众多的教派，如东南地区的宰德教派，丹卡利亚、阿克勒古宰和塞姆哈尔等地区的哈奈非派，萨赫勒和巴尔卡地区的马立克派以及分布全国的苏菲派。