宪法规定行政权属于总统，总统、副总统和内阁组成菲律宾共和国中央政府。总统提名委任各部部长组成内阁（副总统也可被任命为内阁部长）。总统府是总统官邸和办公处，也是菲律宾中央政府的首脑机关。中央政府的主要职权为：实施宪法和法律；负责国家的内政、外交、国防、经济、文化和社会生活等各方面具体事务；制定和执行有关政策措施；领导政府各部门和各级地方政府的工作；向国会提出议案和立法建议；任免政府官员和工作人员；指挥和控制军队、警察，维护社会秩序和国家安全。内阁设有20多个部级机构。另外，总统国家安全顾问、总统执行秘书、总统发言人、内阁秘书也都是内阁成员。总统执行秘书为文官长，他既掌管总统府的日常事务，同时又是总统在国内事务方面的首席顾问，被戏称为“小总统”。2004年5月10日阿罗约获胜连任菲律宾总统，6月30日宣誓就职。本届内阁于2004年8月组成，此后略有调整。内阁成员有24名，除总统外，还有：副总统诺利·德卡斯特罗（Noli de Castro）文官长埃杜阿多·埃米尔塔（Eduardo Ermita）外交部长阿尔韦托·罗慕洛（Alberto Romulo）财政部长凯撒·普里斯马（Cesar V.