在菲律宾出版的第一本书，是1593年用木刻印刷的《圣教教义》（Dcetrine Christiana）。到1604年，弗兰西斯科神父出版了一本他加禄文的作品《最后的舞台》，是用活字版印刷的，至此，活字版印刷术才传入菲律宾。1891年10月24日，根据西班牙国王的法令成立了菲律宾博物图书馆，当时只有几千册图书和十几种报纸。美西战争期间，菲律宾博物图书馆中的许多图书和报纸被毁。1900年5月9日，美国军政当局批准由马尼拉的美国流通图书馆协会成立美国流通图书馆，并将原来的菲律宾博物图书馆中残存的图书移交该馆。这时图书馆的藏书有1万册，主要是英文书籍。由于财政困难，该馆又将这些图书捐赠给美国军政府。1918年1月31日，美国殖民政府发布命令筹建菲律宾国家图书馆以及档案、专利、版权与商标管理局，以及菲律宾国会法律图书馆。1928年12月，博物馆与图书馆分开，分别成立国家博物馆和国家图书馆。国家图书馆迁入国会大楼直到1944年。1942年日本占领菲律宾后很多图书又被毁坏，英语文献一律被视为禁书。1947年菲律宾独立后成立了公共图书馆局，这些图书又转交给该局。1950年，藏书又回到以前的国会大楼。1