西班牙王室与尼德兰人民之间的矛盾不仅表现在政府的横征暴敛上，还表现在尼德兰人民争取宗教自由和西班牙政府对尼德兰新教徒的残暴镇压上。当地的贵族在反抗西班牙统治者的经济压迫上取得了暂时的胜利，但腓力二世仍然不接受这些贵族们的政治要求。在所有的矛盾中，最关键的是对新教徒的迫害仍然没有结束。腓力二世主张的对新教异教徒的镇压在低地国家一直很有争议，并且遭到了越来越强烈的反对。尼德兰不仅新教徒人数越来越多，还出现了人数很多的一个“中间集团”。这些人虽然不是新教徒，但他们仍然出于法律、政治和人道的原因反对国王对新教徒的残酷迫害。在很多城镇，上上下下的人都认为宗教法庭越来越活跃是对他们自治和特权的一种威胁。而且，对异教徒的残酷迫害被认为严重损害了公共秩序和市民的团结。尼德兰的许多城市也出于经济方面的理由反对宗教审判，因为它的活动也危及与来自非罗马天主教地区的外国商人的商业关系。城市地方官员和贵族的圈子里有许多人对宗教法庭随意判处死刑感到恐惧。人们信仰的基督教教义与正统天主教教义不一样就成了许多死刑的原因。尼德兰人民以他们的虔诚和奉献精神著称，但他们也对罗马天主教会的奢华和专制感到愤怒。尼德