日本的细菌战研究始于20世纪20年代末。此后，随着日本对外侵略扩张计划的实施，细菌武器因其投资少、杀伤力强等而引起日本军方的极大关注。1932年8月，日本在东京陆军军医学校成立了细菌研究室，对外称“防疫研究室”，开始进行细菌武器研究。1933年细菌研究室进行扩建，对外改称“防疫研究所”。同年，日本军部批准了石井四郎在中国东北地区建立细菌研究基地的报告。随后，日本关东军在黑龙江省哈尔滨市的南岗区秘密设立了“石井部队”，对外称“关东军防疫给水部”。其后，该部又在黑龙江省五常县的背荫河附近设立了附属细菌试验场，化名为“加茂部队”1779154。随着日本“大陆计划”的推进，细菌战的研究和实施进一步得到日本统治集团的高度重视。1936年，日本陆军省根据天皇敕令签署了陆甲第7号命令，在中国东北组建两支专门从事细菌战研究的特种部队：一支是“关东军防疫给水部”（又称“满洲第731部队”）；一支是“关东军兽疫预防部”（又称“满洲第100部队”）。关于天皇敕令组建2支部队的事宜，战后，日本细菌战战犯、原关东军医务部长梶塚隆二在苏联伯力接受审判时供称：“第731部队是根据天皇1936年敕令组建的……我个人读