1947年，土耳其对联合国巴勒斯坦分治决议表示反对。土耳其担心以色列国将是共产主义政权。基布兹的发展、工会作用的扩大、以军使用苏式武器等现象表明，以色列有可能是苏联在中东扶植起的一个共产主义卫星国。在第一次中东战争中，土耳其保持中立。但在1949年3月24日，土耳其正式承认以色列国，是世界上第一个承认以色列并与之建交的伊斯兰国家。1950年1月，两国互建外交代办处，在联合国形成了投票联盟，政治关系迅速升温。土耳其允许保加利亚、叙利亚和伊拉克犹太人转道土耳其移居以色列。50年代，两国成为重要的贸易伙伴。但在50年代中期，土耳其对待以色列的态度明显发生变化。1955年，土耳其拉拢伊拉克等国组建亲美、反苏的巴格达条约组织，并称“土以关系是微不足道的”。1956年苏伊士运河战争爆发后，土耳其谴责以色列是对中东和平的最大威胁。1956年11月，土耳其外交部宣布召回驻以色列公使。12月，两国外交关系降至代办级。其实，这只不过是一个外交姿态而已，多年来，土以两国互派的外交使团人员都很齐备，而且通常由大使头衔的外交官担任“代办”。1957年，土耳其总理孟德里斯和外长左鲁在巴黎秘密会见以色列驻意大利大使