乌兹别克斯坦同日本的关系起步较晚。1993年2月，日本外务省代表团访乌，双方商讨了日本向乌提供技术援助和贷款问题。同年6月，日本通产省代表团访乌，提出建立“21世纪的丝绸之路”。双方同意组建乌日合资企业和两国混合经济委员会。1992～1993年，日本政府大藏省、外务省和通产省等部门的代表团先后访乌。1994年5月中旬，乌兹别克斯坦总统卡里莫夫访日，与日本首相羽田孜就发展两国合作关系举行会谈，双方签订两国间经济、科技合作和文化交流等协议。此后两国间的政治经济关系有了新的发展，乌兹别克斯坦明确表示支持日本成为联合国安理会常任理事国。1997年9月上旬，日本政府经济企划厅长官访乌，日本对乌方倡议召开的建立“中亚无核区”国际会议做出积极的反应。乌兹别克斯坦与日本签订了经贸合作、科技合作、鼓励和保护投资等协议。1995～1997年，日本先后向乌兹别克斯坦提供2.46亿美元贷款，用于开采天然气和石油加工；向乌提供292.8亿日元贷款，用于改建塔什干车辆厂和撒马尔罕、布哈拉的飞机场等。1996年乌兹别克斯坦与日本的双边贸易额为6090万美元（1992年为1030万美元）。2001年12月，乌兹别克斯