菲律宾曾经是美国的殖民地，美菲两国保持着密切的历史、经济、文化和人员往来。目前，生活在美国的菲律宾裔约有200万人，生活在菲律宾的美国公民有13万多人，而每年访问菲律宾的美国游客也有40万人之多。根据1947年的美菲《军事基地协议》，1992年之前美国在菲律宾一直保有苏比克海军基地等军事设施。在菲律宾的要求下，美军在1992年11月24日全部撤离，归还了全部军事基地。不过，基于1952年签署的《美菲防卫互助条约》（U.S.—Philippines Mutual Defense Treaty），两国仍然保持着密切的安全合作关系。1998年2月，美菲两国又签署了《来访部队协定》（Visiting Forces Agreement），促进双边军事合作，开展联合军事演习和军舰互访活动。在政治上，美菲两国高层往来比较频繁。1998年4月，菲律宾总统拉莫斯访问了美国。1999年1月，美国国防部长科恩访问菲律宾。美国航空母舰获准在菲律宾港口停泊。2000年7月，菲律宾总统埃斯特拉达访美。2002年8月美国国务卿鲍威尔访问菲律宾。同年11月美菲签署了《后勤互助协定》（Mutual Logistics