美苏冷战时期，为了对抗苏联与印度的同盟及其在南亚的影响，美国与巴基斯坦结成了美巴同盟关系。苏联解体后，美国看待南亚国家的视角随之改变，开始重新审视南亚各国对美国的重要性，巴基斯坦在南亚格局中的战略地位迅即下降，美国转而寻求与印、巴分别发展独立的双边关系。1990年10月，美国以巴基斯坦研制核武器和支持恐怖活动为由，停止了对其经济援助、军事援助和军火销售，两国关系转入冷淡。然而，美巴关系僵硬并不符合两国的利益。1991年6月，巴基斯坦政府提出就解决双边关系中存在的问题举行对话。1993年4月，美国宣布对印巴实行“不偏不倚”的政策。1993年10月，贝·布托在巴基斯坦重新执政，致力于修复与美国的传统关系。与此同时，美国也希望继续保持和发展同巴基斯坦的关系，以便在反恐、核不扩散、扫毒和遏制伊斯兰原教旨主义等方面得到巴基斯坦的合作。1995年1月，美国国防部长佩里访问巴基斯坦，使中断了4年的美巴军事磋商和美巴军事工作小组的活动得以恢复。同年4月，巴基斯坦总理贝·布托访美，实现了冷战后巴基斯坦总理首次访美。9月，美国国会通过了《布朗修正案》，决定部分取消对巴基斯坦的军售限制，同意向巴基斯坦提供军