在1971年8月27日，乍得政府宣布粉碎了一次反政府的未遂政变，事后乍得政府指责利比亚参与政变，并宣布与利比亚断交。之后，利比亚占领乍得北方奥祖一带领土，支持乍得反政府武装。1977年以来，乍得在非洲统一组织会议上对利比亚提出控告，非洲统一组织和中、西部非洲国家对乍得内战和外部势力插手十分关切，非洲统一组织外长会议和首脑会议曾多次讨论乍得问题，设立了专门委员会进行调解。乍得的邻国分别推动乍得各派和解，并都先后参加了在尼日利亚的卡诺和拉各斯召开的4次乍得全国和解会议。1979年11月，古库尼在乍得全国团结过渡政府中掌权后，于1980年6月同利比亚签订了“友好同盟条约”；应古库尼要求，利比亚出兵乍得，协助攻打哈布雷部队。哈布雷执政后，利比亚不承认哈布雷政权，两国关系更加紧张。利比亚继续支持前“全国团结过渡政府”主席古库尼。哈布雷政府则一再指控利比亚侵略乍得领土，要求利比亚军队从乍得领土全部撤出。1983年6月，乍得内战再起，哈布雷政府谴责利比亚干涉乍得事务和破坏领土完整。1985年1月，乍得政府向联合国安理会控诉利比亚企图谋杀哈布雷总统，利比亚矢口否认。1986年2月17日，乍得外交合作部