早在幕府成立之前，源赖朝就在镰仓建立了能够控制日本全国的统治机构。这一中央政权分为三个部门，即统率军事力量的“侍所”（后改为“政所”）、处理行政事务的“公文所”和相当于司法机构的“问注所”，而对地方的控制是通过派遣“守护”和“地头”实施的。1185年，源赖朝迫使天皇承认他拥有在地方各国派遣“守护”以及在全国所有庄园、公家领地设置“地头”的权力。“守护”是镰仓政权派到各地国衙的政治代表，其主要职责为：对辖区内犯有谋反、凶杀的罪犯进行检察、审判、镇压；组织武士定期轮番上京，守卫京都皇宫，兼管辖区内的神社寺院、交通道路等行政事务。“地头”是镰仓政权派驻庄园及公家领地的政治代表。“地头”既有镇压庄民反抗以及追捕强盗的警察权，又拥有征收赋税、军粮以及原有庄官的职责，而且“地头”不受庄园领主的制约，只听命于镰仓政权。镰仓幕府的经济基础以将军所拥有的封地和直辖领地为中心，即“关东知行国”和“关东御领”。“关东知行国”也称为“关东御分国”，为将军的封地，最多时达到9个，即为相模（今神奈川县）、伊豆（今静冈县）、上总（今千叶县）、信浓（今长野县）、越后（今新潟县）、骏河（今静冈县）、武藏（今埼玉县）、下