截至目前，拉美社科院共举行25届大会和48届高级理事会会议。 2022年6月，拉美社科院第24届大会在厄瓜多尔基多举行，大会总结2020－2022年工作，通过2022－2024年工作规划，选举新一届高级理事会成员并投票表决，正式接纳中国成为该院观察员国。 2024年6月，拉美社科院第25届大会和第47届高级理事会会议在智利圣地亚哥举行，审议通过秘书处工作、同域外观察员国合作及学术财务等报告，选举新任秘书长、新一届高级理事会独立理事和分院院长。 2025年6月，拉美社科院第48届高级理事会会议在危地马拉城举行，会议审议2024－2028年工作规划以及关于技术研究与合作、预算与审计等年度报告，并通过古巴、巴拉圭分院新任院长提名。

1、大会：最高决策机构，负责制定发展、对外交往等规划，每2年举行一届，成员国和观察员国外交部等政府部门牵头与会。 2、高级理事会：由7名成员国代表及6名独立理事组成，每年召开一次会议，负责审议预算、年度报告等。 3、领导委员会：由秘书长、各分院院长、教师代表等组成，负责制定教学计划、撰写年度报告、人事任免等，每年召开3次会议。 4、秘书处：负责协调教学、研究、对外合作等工作。 5、分院：在阿根廷、巴拉圭、巴西、多米尼加、厄瓜多尔、哥斯黎达加、古巴、洪都拉斯、墨西哥、萨尔瓦多、危地马拉、乌拉圭、智利设有13家分院，按等级分为研究所、项目部和阶段性学术项目。

成员国18个：阿根廷、巴拉圭、巴拿马、巴西、秘鲁、玻利维亚、多米尼加、厄瓜多尔、哥斯黎达加、古巴、洪都拉斯、墨西哥、尼加拉瓜、萨尔瓦多、苏里南、危地马拉、乌拉圭、智利。观察员国2个：西班牙、中国。