新疆师范大学中亚研究中心负责制定全校中亚研究发展规划，领导、统筹、协调全校的中亚研究工作，部署各个阶段的具体任务。中心设立学术委员会，负责指导中亚研究规划、招标课题等；咨询委员会，负责中亚研究的工作、政策咨询等；专家委员会，负责中亚研究项目的申报和实施等；工作小组，负责中亚研究的协调工作等。 中亚研究中心坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面落实科学发展观，解放思想、转变观念，聚集全校资源，紧紧围绕学科建设、学位点建设、重点文科基地建设、优先发展学科建设，集中开展中亚政治、法律、经济、语言、文化、民族、宗教、教育、艺术等问题的研究，为国家战略做出贡献。